Inscríbete en el Curso intensivo de Espectroscopía de Masas (MS) y Metabolómica aplicada
Doctorado en Ciencias mención Investigación y Desarrollo de Productos Bioactivos
(Decreto 1257 del 10 de septiembre de 2013)
| NOMBRE DEL CURSO | |
| Curso intensivo de Espectroscopía de Masas (MS) y Metabolómica aplicada Intensive course on Mass Spectroscopy (MS) and Applied Metabolomics | |
| Prerrequisitos | |
| Creditaje | 3 Créditos STC |
| Horas presenciales y no presenciales | 30 horas presenciales, 60 horas trabajo autónomo y talleres |
| Horario | El curso se dictará en marzo de 2025, actividades y horarios en cronograma adjunto |
| Profesor responsable | Vladimir Shulaev, North Texas University, USA |
| Profesores participantes | Andy Pérez (Univ. Concepción), Felipe Jiménez (Univ. Hohenheim), Alberto Burgos (Univ. Nacional de Asunción), Nélida Nina (Univ. Mayor de San Andrés, La Paz), Guillermo Schmeda (Coordinador) |
| DESCRIPCIÓN DEL CURSO | |
| Este curso está diseñado para enseñar los principios básicos y técnicas de investigación en OMICS (transcriptómica, proteómica, metabolómica y bioinformática), biología de sistemas y genética funcional, así como escritura de proyectos. This course is designed to teach the basic principles and techniques of OMICS (transcriptomics, proteomics, metabolomics, and bioinformatics) research, system biology, and functional genetics, as well as grant writing. | |
| OBJETIVOS | |
| El objetivo principal de este curso es preparar al estudiante para el paisaje avanzado y complejo de la investigación de punta en biología/estudios multidisciplinarios/interfase entre química y biología. La comprensión de los principios, métodos y usos de las nuevas técnicas de OMICS contribuirá en forma importante al futuro del estudiante en la academia e industria. Course Objectives and Goals: The goal of this course is to prepare the student for the advanced and complex landscape of today’s cutting-edge research in biology. Understanding the principles, methods and uses of the newest OMICS techniques and systems biology will contribute greatly to the student’s future in academy and industry. | |
| CONTENIDOS | |
| Los temas para desarrollar incluyen una revisión de las técnicas y patrones de fragmentación más característicos en espectrometría de masas, para trabajar a continuación con las diferentes plataformas de microarreglos y GeneChip, proteómica, metabolómica (cromatografía liquida acoplada a MS y GC-MS), transcriptómica (RNAseq), NextGen secuenciación del genoma, análisis de mutantes, bioinformática y biología de sistemas. Subjects covered will include different microarray and GeneChip platforms, proteomics, metabolomics (LC- and GC-MS), transcriptomics (RNAseq), NextGen whole genome shotgun sequencing, mutant analysis, bioinformatics, and systems biology. | |
| MODALIDAD DE EVALUACIÓN | |
| Cada estudiante o grupo pequeño de participantes, deberá presentar una propuesta de investigación sobre uno de los temas seleccionados durante el curso. Para ello, se seleccionará un tema diferente para cada participante/grupo y una vez aprobado por el instructor, deberán escribir y presentar la propuesta (mínimo 5 páginas, Times New Roman 12, espacio simple) y presentarla a los participantes. El tema será discutido entre todos los participantes con relación a su importancia, la validez de las preguntas científicas presentadas, el mejor diseño experimental para abordarla y la estrategia de escritura del grant. Los proyectos serán calificados según su calidad. In addition to the lectures, each student (or a team of 2-4 students, depending on class size) will be required to present a talk about a selected project and write a proposal (project) on a given subject. For this purpose, the student(s) will choose a subject and upon approval by the instructor will write the project proposal (5 pages minimum) and present the subject to the class. The subject will then be discussed by the entire class with respect to its importance, the validity of the scientific questions presented, the best experimental design(s) to be used, and the strategy of writing the grant. The student(s) project will be graded on its quality. There will be no written exam. | |
| BIBLIOGRAFÍA | |
| Básica | Required Text: There is no textbook required for this course. Each week the students will be given one or more research papers to read. PDF of these, as well as PowerPoint and PDF files of the lectures. |
| Recomendada a leer antes de iniciar el curso | https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jasms.3c00122 https://doi.org/10.1002/mas.20353 Glish, G., Vachet, R. The basics of mass spectrometry in the twenty-first century. Nat Rev Drug Discov 2, 140–150 (2003). https://doi.org/10.1038/nrd1011 DOI: 10.1039/C5NP00073D (Review Article) Nat. Prod. Rep., 2016, 33, 432-455 |
